全自动双侧机床控制系统设计是一个涉及机械工程、电子工程和计算机科学等多个领域的复杂项目。以下是一个基本的设计概述：

需求分析：首先，需要明确机床的具体需求。这包括机床需要执行的操作、加工材料的类型、加工精度要求、生产速度等。这些需求将决定控制系统的基本结构和功能。

硬件选择：根据需求分析的结果，选择合适的硬件。这可能包括电机、传感器、执行器、PLC（可编程逻辑控制器）或CNC（计算机数控）系统等。这些硬件需要能够满足机床的性能要求，并且能够在所需的环境中稳定运行。

软件设计：控制系统的软件部分负责接收输入、处理数据并发出控制指令。软件设计需要考虑到机床的运动控制、传感器数据处理、错误检测和处理等多个方面。可以使用C/C++、Python等语言进行编程，也可以使用专业的控制系统开发软件，如AutoCAD Electrical、SolidWorks Electrical等。

人机界面设计：为了方便操作人员使用，需要设计一个友好的人机界面。这个界面可以显示机床的当前状态、接收操作人员的输入并显示结果。可以使用触摸屏、按钮、开关等设备进行设计。

系统集成和测试：将硬件和软件集成在一起，并进行详细的测试。测试需要覆盖所有可能的工作场景，以确保控制系统在各种情况下都能稳定运行。

优化和改进：根据测试结果，对控制系统进行优化和改进。这可能包括调整控制算法、优化人机界面、改进硬件设计等。

以上是一个全自动双侧机床控制系统设计的基本流程。需要注意的是，这个过程可能涉及到很多复杂的技术和概念，需要有丰富的知识和经验。如果你不熟悉这些领域，建议寻求专业的帮助。